A Congregação é o órgão superior da Unidade, de caráter consultivo e deliberativo.
De acordo com o art. 5º, do Regimento da EEFERP, compete à Congregação, além do disposto no art. 39 do Regimento Geral da USP:
| MEMBROS DA CONGREGAÇÃO | ||
| Nome | Início de mandato | Fim de mandato |
| Diretor | ||
| Presidente - Prof. Assoc. Hugo Tourinho Filho | 15/08/2021 | 14/08/2025 |
| Vice-Diretor | ||
| Vice-Presidente - Prof. Assoc. Rafael Pombo Menezes | 15/08/2021 | 14/08/2025 |
| Comissão de Graduação - CG | ||
| Titular - Prof. Assoc. Enrico Fuini Puggina | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Suplente - Prof. Dr. Márcio Pereira Morato | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Comissão de Pós-Graduação - CPG | ||
| Titular - Prof. Tit. Renato Francisco Rodrigues Marques | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Suplente - Prof. Assoc. Enrico Fuini Puggina | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Comissão de Pesquisa e Inovação - CPqI | ||
| Titular - Prof. Dr. Camila de Moraes | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Suplente -Prof. Tit. Marcelo Papoti | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Comissão de Cultura e Extensão Universitária - CCEx | ||
| Titular - Prof. Tit. Myrian Nunomura | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Suplente - Prof. Dr. Átila Alexandre Trapé | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Comissão de Inclusão e Pertencimento - CIP | ||
| Titular - Prof. Dr. Átila Alexandre Trapé | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Suplente - Prof. Dr. Camila de Moraes | 21/08/2023 | 14/08/2025 |
| Representante dos Professores Titulares | ||
| Prof. Tit. Maria Helena Palucci Marziale | 10/09/2022 | 09/09/2024 |
| Prof. Tit. Myrian Nunomura | 02/01/2017 | - |
| Prof. Tit. Marcelo Papoti | 06/07/2018 | - |
| Prof. Tit. Cristiano Roque Antunes Barreira | 24/06/2022 | - |
| Prof. Tit. Renato Francisco Rodrigues Marques | 24/01/2024 | - |
| Representante dos Professores Associados | ||
| Titular - Prof. Assoc. Adelino Sanchez Ramos da Silva | 21/08/2023 | 20/08/2025 |
| Suplente - Prof. Assoc. Renato de Moraes | 21/08/2023 | 20/08/2025 |
| Titular - Prof. Assoc. Ellen Cristini de Freitas | 21/08/2023 | 20/08/2025 |
| Suplente - | ||
| Titular - Prof. Assoc. Enrico Fuini Puggina | 20/08/2023 | 20/08/2025 |
| Suplente - Prof. Assoc. Rafael Pombo Menezes | 21/08/2023 | 20/08/2025 |
| Titular - Prof. Assoc. Paulo Roberto Pereira Santiago | 21/08/2023 | 20/08/2025 |
| Suplente - Prof. Assoc. Hugo Tourinho Filho | 21/08/2023 | 20/08/2025 |
| Representante dos Professores Doutores | ||
| Titular - Prof. Dr. Leonardo Coelho Rabello de Lima | 16/10/2023 | 15/10/2025 |
| Suplente - Prof. Dr. Matheus Machado Gomes | 16/10/2023 | 15/10/2025 |
| Titular - Prof. Dr. Márcio Pereira Morato | 16/10/2023 | 15/10/2025 |
| Suplente - Prof. Dr. Átila Alexandre Trapé | 16/10/2023 | 15/10/2025 |
| Titular - Prof. Dr. Tiago Rezende Figueira | 16/10/2023 | 15/10/2025 |
| Suplente - Prof. Dr. Camila de Moraes | 16/10/2023 | 15/10/2025 |
| Representante Discente de Graduação | ||
| Titular - Maria Gabriela dos Santos | 23/04/2024 | 22/04/2025 |
| Suplente - | ||
| Representante dos Servidores Técnicos e Administrativos | ||
| Titular - Daniel Gerolineto | 30/10/2023 | 29/10/2024 |
| Suplente - | ||
| Representante da Congregação no CO | ||
| Titular - Prof. Assoc. Rafael Pombo Menezes | 18/11/2023 | 17/11/2025 |
| Suplente - Prof. Assoc. Enrico Fuini Puggina | 18/11/2023 | 17/11/2025 |
